โรงเรียนชัยมงคลพิทยา จัดสอนโดยใช้หลักสูตรโรงเรียนชัยมงคลพิทยา พุทธศักราช 2565 ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ปรับปรุง พ.ศ.2560) ได้จัดหลักสูตรการเรียนการสอนดังนี้

 - ระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น มีทั้งหมด 6 ห้องเรียน
 - ระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย มีทั้งหมด 6 ห้องเรียน

  ห้อง 1 แผนการจัดการเรียนรู้ วิทยาศาสตร์ – คณิตศาสตร์
  ห้อง 2 แผนการจัดการเรียนรู้ ศิลป์ – ทั่วไป

 โรงเรียนชัยมงคลพิทยา ได้จัดกิจกรรมการเรียนสอนซึ่งมีรายละเอียด ดังนี้

  - แผนการจัดการเรียนรู้ วิทยาศาสตร์ – คณิตศาสตร์ เป็นห้องเรียนที่ส่งเสริมศักยภาพด้านวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์
  - แผนการจัดการเรียนรู้ ศิลป์ – ทั่วไป เป็นห้องเรียนที่จัดการเรียนการสอนที่มุ่งเน้นให้ผู้เรียนมีทักษะทางวิชาชีพ สามารถนำเป็นพื้นฐานในการประกอบวิชาชีพได้

 พร้อมเสริมจัดรายวิชาเพิ่มเติมเพื่อเพิ่มศักยภาพและสนองต่อวิสัยทัศน์ของโรงเรียน เช่น การศึกษาค้นคว้าด้วยตนเอง (IS) เพื่อส่งเสริมทักษะกระบวนการด้านการคิด การแก้ปัญหา การใช้สติปัญญาความรอบรู้ สามารถสร้างองค์ความรู้ให้เกิดขึ้นได้ด้วยตนเอง โดยบูรณาการกับหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงกับทุกกลุ่มสาระการเรียนรู้